医药物流管理信息系统MLIS（MedicineLogisticsInformationSystem）是由人员、计算机硬件、软件、网络通信设备及其它办公设备组成的人机交互系统。
其主要功能是通过对信息的收集、存储、传输、加工整理、维护和输出，实现对线体、分拣、堆垛和终端设备的驱动和对作业过程的跟踪，为操作人员提供作业支持，为管理人员提供决策支持，以实现提高效率、降低成本、防止出错的目的，进而提高企业竞争力。
一套完整的医药物流管理信息系统MLIS通常包括企业资源计划ERP（EnterpriseResourcePlanning），仓库管理系统WMS（WarehouseManagementSystem）和运输管理系统TMS（TransportationManagementSystem）三个子系统。
三个子系统分别对应医药物流企业的采购营销系统、仓储系统和运输配送系统。
为满足业务需要，每个系统都设有相应的规则。
1-1入库
如某药品来货57件+20盒。
进入整垛库前，先将货品和托盘绑定（多对1），再将托盘和货位绑定（1对1）。进入整件库和散件库前，先将货品和中包装与货位绑定（多对1）。
1-2出库
该药品出库盒（=25件+4个中包装）。
1-3补货规则
散件库存不足，由整件库拆至中包装补货。整件库存不足，由整垛库与托盘解绑后补货。
1-5组波方式
整垛库、整件库按品种、批号拣货，散件库按订单拣货，等货品流至集货区再按线路集中、按客户分货。
1-6拣货、复核
整垛库、整件库根据品种、批号打印标签，以标签拣货，复核只需二次扫码即可。散件库根据任务注册桶号，沿途作业人员或自动拣货设备扫描桶号，根据任务拣货，将货品与桶绑定（多对1），最后由复核员将货品和桶解绑，封箱并贴标签。
2-1理货
除整垛库货品直接由叉车或电梯整板送至集货区指定客户理货位外，整件库、散件库货品都按件由线路输送至集货区，先按线路集中，再分到各客户集货位。
2-2派车
下架后，TMS根据各客户所在地址、要求到货时间、货量多少，各线路交通情况，各自运车况，各承运商协议，将货品和线路、车辆或承运商绑定，并指定装车顺序。
2-3到货跟踪
出车前司机刷卡验证个人信息。扫描路单，确认送货路线、各客户货量和要求到货时间。到货后扫描货单，确认货已到客户处，正在交接中。客户签单后扫描签单、货品，并拍照上传确认交接完成。
3-1数据共享
收货完成后，WMS将数据上传至ERP，供采购与供应商对账，付款。配送完成后，TMS将数据上传至ERP，供销售与客户对账，开票收款。
仓库作业过程中，WMS会与ERP共享实时库存，以便采购和业务下采购、销售计划。运输配送过程中，TMS会与ERP共享车辆、货品、司机、承运商和实时路况信息，并提供延误预警，以便业务与客户沟通。
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